Думаю,что "Вавилон" в Откровении это образное сравнение с религиозно-политической системой в обществе. Эта система названа также блудницей - т.е. эта та часть Вавилона которая именно относилась к церкви Христовой и стала блудницей, потому что изменила Христу с миром сим и с его князем-сатаной.

Настоящее Христианство там, где во главе всего Христос и Его Слово, а не понятия людей.